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基于網(wǎng)絡藥理學的麥冬治療糖尿病成分和機制及其配伍后作用通路改變研究(一)

發(fā)布時間:2021-04-29 19:24 編輯者:夏德婷

糖尿病在中醫(yī)屬于消渴范疇,以陰液虧損為本、燥熱偏勝為標。麥冬養(yǎng)陰潤燥、清熱生津,能療消渴陰虛之本。文獻報道,麥冬發(fā)揮降糖作用的成分多為麥冬多糖。麥冬中還含有70余種甾體皂苷、30余種高異黃酮類化合物,其是否有潛在降糖活性尚未明確。

中藥中復雜的化學成分通過多靶點、多途徑發(fā)揮作用,通過配伍和組方與其他藥味相互作用,共同發(fā)揮藥效。網(wǎng)絡藥理學整體性、系統(tǒng)性和注重藥物間相互作用的特點與中醫(yī)藥學的基本特點相吻合,有利于揭示中藥復雜的作用機制。

中醫(yī)治療糖尿病主要以清熱潤燥、養(yǎng)陰生津為主。由于本病常發(fā)生血脈瘀滯及陰損及陽的病變,且易并發(fā)癰疽、眼疾、勞嗽等癥,故還應針對具體病情,及時合理地選用活血化瘀、清熱解毒、健脾益氣、滋補腎陰、溫補腎陽等治法。麥冬養(yǎng)陰潤燥、清熱生津,療消渴陰虛之本,黃芪補氣升陽、布津攝液;北沙參多入上焦,清肺熱、養(yǎng)肺陰,麥冬善入中焦,清胃熱、益胃陰,兩藥相須為用;丹參活血化瘀,黃連清熱瀉火,配伍麥冬增強清熱之力,使火去而津液自復,補虛而瀉實;麥冬-山藥-五味子三藥合用,可增強補腎養(yǎng)陰、潤肺作用。本研究依據(jù)中醫(yī)補氣、滋陰、清熱、活血、酸甘化陰等治療糖尿病基本的組方配伍方式,研究麥冬單味藥及配伍后治療糖尿病的潛在活性成分及作用機制,為進一步結合麥冬配伍后成分變化規(guī)律、血清藥物化學、代謝組學、體外及體內降糖活性追蹤等技術探究其具體成分群提供參考。

1 材料與方法

1.1 麥冬及其配伍后化學成分與靶點的獲取

釆用TCMID(http://www.megabionet.org/tcmid/)、Batman-TCM(http://bionet.ncpsb.org/ batman-tcm/)數(shù)據(jù)庫,結合文獻挖掘的方法,收集麥冬單味藥及其配伍的化學成分。

根據(jù)Batman-TCM數(shù)據(jù)庫默認的閾值(prediction score cutoff>20),篩選可信度高的蛋白作為候選靶點,其中麥冬為重點研究對象,閾值選擇prediction score cutoff>15。使用UniProt數(shù)據(jù)庫中UniProtKB功能(http://www.uniprot.org/),限定蛋白物種為人,校正蛋白名稱。

1.2 糖尿病作用靶點的獲取

在CTD(http://ctdbase.org/)、TTD (http://bidd.nus.edu.sg/group/cjttd/)、DrugBank (https://www.Drugbank.ca/)數(shù)據(jù)庫輸入diabetes、diabetes mellitus等關鍵詞,獲得糖尿病相關靶點。

1.3 藥味-成分-靶點網(wǎng)絡的構建

將篩選得到的成分和靶點數(shù)據(jù)導入Cytoscape 3.7.2軟件(http://www.cytoscape.org/),構建藥味-成分-靶點網(wǎng)絡。

1.4 蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)網(wǎng)絡構建及分析

使用STRING 10.0(http://string-db.oig/)工具構建麥冬及其配伍后靶點PPI網(wǎng)絡,并進行拓撲分析和模塊分析。拓撲分析采用Cytoscape 3.7.2軟件進行Network Analyzer分析。以網(wǎng)絡節(jié)點中的拓撲結構特征值度(degree)和中介中心度(betweenness centrality, BC)為指標篩選關鍵靶點。模塊分析采用Cytoscape 3.7.2軟件ClusterViz插件中的MCODE算法,設置score>2,即至少包含3條邊。

1.5 通路分析

通過DAVID 6.8(https:// david.ncifcrf.gov/)數(shù)據(jù)庫對上述預測得到的關鍵靶點信息進行基因本體(GO)富集分析和京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路注釋分析,并運用GraphPad Prism 5繪圖。

2 結果

2.1 麥冬及其配伍后成分和靶點篩選

共篩選得到麥冬化學成分22個、靶點236個;黃芪化學成分和靶點分別為35、415個,麥冬與黃芪配伍共有靶點為96個;黃連化學成分和靶點分別為23、132個,麥冬與黃連配伍共有靶點為24個;山藥化學成分和靶點分別為20、478個,五味子化學成分和靶點分別為112、930個,麥冬與山藥、五味子配伍共有靶點為146個;丹參化學成分和靶點分別為75、769個,麥冬與丹參配伍共有靶點為82個;北沙參化學成分和靶點分別為17、181個,麥冬與北沙參配伍共有靶點為172個。

2.2 糖尿病靶點篩選

基于多個數(shù)據(jù)庫共檢索到糖尿病相關靶點181個,其中麥冬涉及靶點20個,占糖尿病靶點數(shù)的11.05%;麥冬與黃芪共有相關靶點13個,黃芪涉及靶點27個,分別占糖尿病靶點數(shù)的7.18%、14.91%;麥冬與黃連共有相關靶點9個,黃連涉及靶點13個,分別占糖尿病靶點數(shù)的4.97%、7.18%;麥冬與山藥共有相關靶點14個,山藥涉及靶點32個,分別占糖尿病靶點數(shù)的7.73%、17.68%;麥冬與五味子共有相關靶點13個,五味子涉及靶點41個,分別占糖尿病靶點數(shù)的7.18%、22.65%;麥冬與丹參共有相關靶點9個,丹參涉及靶點41個,分別占糖尿病靶點數(shù)的4.97%、22.65%;麥冬與北沙參共有相關靶點11個,北沙參涉及靶點13個,分別占糖尿病靶點數(shù)的6.08%、7.18%;麥冬與各藥味配伍后,涉及靶點58個,占糖尿病靶點數(shù)的32.04%。藥味-成分-靶點網(wǎng)絡見圖1。

2.3 PPI網(wǎng)絡分析

使用STRING工具構建PPI網(wǎng)絡,見圖2。其中麥冬單味藥治療糖尿病靶點的PPI網(wǎng)絡包括20個節(jié)點和24條邊;麥冬與黃芪配伍治療糖尿病靶點的PPI網(wǎng)絡包括33個節(jié)點和74條邊;麥冬與黃連配伍治療糖尿病靶點的PPI網(wǎng)絡包括24個節(jié)點和36條邊;麥冬與丹參配伍治療糖尿病靶點的PPI網(wǎng)絡包括51個節(jié)點和259條邊;麥冬與北沙參配伍治療糖尿病靶點的PPI網(wǎng)絡包括22個節(jié)點和33條邊;麥冬與山藥、五味子配伍治療糖尿病靶點的PPI網(wǎng)絡包括48個節(jié)點和244條邊;麥冬與所有藥味共同配伍后,共包括58個節(jié)點和330條邊。

聲明:本文所用圖片、文字來源《中國現(xiàn)代中藥》,版權歸原作者所有。如涉及作品內容、版權等問題,請與本網(wǎng)聯(lián)系刪除。

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