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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討逍遙散“異病同治”抑郁癥、乳腺增生和功能性消化不良的作用機(jī)制(三)

發(fā)布時(shí)間:2021-05-21 19:26 編輯者:特邀作者余秀梅

2.3 關(guān)鍵靶點(diǎn)的查找以及關(guān)鍵活性成分的查找

把38個(gè)共有靶點(diǎn)導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫(kù),并設(shè)置interaction score>0.9,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)。PPI網(wǎng)絡(luò)包含35個(gè)靶點(diǎn)以及121條邊(圖3A)。利用Cytoscape 3.7.1軟件的MCODE插件對(duì)該網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行聚類分析,共得到3個(gè)子網(wǎng)絡(luò)。根據(jù)得分最高創(chuàng)建核心靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖(圖3B)。核心靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)(得分8.222)中的節(jié)點(diǎn)有:IL-6、IL-4、TNF、IL-1A、ICAM1、CCL2、CXCL8、IL-1B、IL-10和IFNG。

根據(jù)“單味藥-活性成分-共同靶點(diǎn)”相互作用網(wǎng)絡(luò)篩選得到的關(guān)鍵靶點(diǎn)搜尋到相應(yīng)的8個(gè)關(guān)鍵活性成分:槲皮素(MOL000098)、山柰酚(MOL000422)、β-谷固醇(MOL000358)、蘆薈大黃素(MOL000471)、Glyasperins M(MOL000354)、刺芒柄花素(MOL000392)、金合歡素(MOL001689)和柚皮素(M OL004328)。

2.4 通路分析

將上述獲得的逍遙散治療抑郁癥、乳腺增生和功能性消化不良的共同靶點(diǎn)輸入Metascape數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行KEGG通路注釋分析。根據(jù)P<0.05對(duì)KEGG通路結(jié)果進(jìn)行篩選,共得到17條相關(guān)通路,其中包括糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號(hào)通路 (AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、HIF-1信號(hào)通路 (HIF-1 signaling pathway)以及癌癥通路 (pathways in cancer)等通路(圖4A)。GO富集結(jié)果表明,在生物過(guò)程(biological process)中,逍遙散對(duì)脂多糖(response to lipopolysaccharide)、活性氧代謝 (reactive oxygen species metabolic process)以及細(xì)胞因子介導(dǎo)的通路 (cytokine-mediated signaling pathway)等的影響較大;在分子功能(molecular function)層面上,逍遙散對(duì)細(xì)胞因子 (cytokine receptor binding)、磷酸酶 (phosphatase binding)以及血紅素(heme binding)等的影響較大;在細(xì)胞組分(cellular component)中,逍遙散對(duì)膜筏 (membrane raft)、囊泡(vesicle lumen)以及核包膜 (nuclear envelope)的影響較大(圖4B)。

聲明:本文所用圖片、文字來(lái)源《中國(guó)中藥雜志》,版權(quán)歸原作者所有。如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問(wèn)題,請(qǐng)與本網(wǎng)聯(lián)系刪除。

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