北方偉業(yè)計量集團(tuán)有限公司
據(jù)外媒報道,盡管科學(xué)家已經(jīng)完成了整個人類基因組的測序但仍有一些空白。現(xiàn)在,遺傳學(xué)家在一項具有里程碑意義的新研究中帶來了一個重要的基因序列,即對整個人類X染色體從頭到尾進(jìn)行測序并覆蓋了300多萬個此前沒有被繪制出來的堿基對。
人類基因組計劃是有史以來最雄心勃勃的科學(xué)事業(yè)之一。從1990年到2003年,一個由國際科學(xué)家組成的團(tuán)隊對人類基因組進(jìn)行了非常詳細(xì)的排序,最終得到了一個幾乎完整的人類物種藍(lán)圖。
但這里的重點是“幾乎”。第一個版本覆蓋了人類基因組的92%多一點,準(zhǔn)確率超99.99%。后來的修訂雖然彌補(bǔ)了一些差距,但仍沒有做到完全覆蓋。而其中最大的缺口位于染色體的中心和末端,分別被稱為著絲粒和端粒。這些區(qū)域被大量重復(fù)的序列分類,所以很難對其展開分類。
現(xiàn)在,一個由遺傳學(xué)家組成的國際團(tuán)隊已經(jīng)填補(bǔ)了這些空白。據(jù)了解,研究人員首次成功地從端粒到端粒對整個X染色體進(jìn)行了測序。
在人類中,X染色體是父母傳給孩子的決定性別的染色體之一。一般來說,一個受精卵接收到兩條X染色體--一條來自母親一條來自父親。
在最新的研究中,研究小組并沒有對一個正常人類細(xì)胞的X染色體進(jìn)行測序,相反,他們研究了一種特殊類型的細(xì)胞,這種細(xì)胞含有兩條相同的染色體,是被稱為CHM13的模型基因組的一部分。
而基因組測序面臨的一個問題是,傳統(tǒng)的技術(shù)一次只能讀取一小段DNA,然后再讓科學(xué)家們將它們拼在一起。不幸的是,當(dāng)這些片段不斷重復(fù)時,這項工作就變得特別困難,研究小組將其比作組裝一個只有一種顏色的拼圖。
為了解開這個謎題,研究小組使用了一次讀取更長序列的新技術(shù)。其中一種技術(shù)被稱為“納米孔技術(shù)”,它將DNA的單個分子通過一個小孔然后通過檢測電流的變化對其進(jìn)行排序。
“雖然這些大量重復(fù)的序列曾被認(rèn)為是難以處理的,但現(xiàn)在我們在測序技術(shù)上取得了飛躍,”該項目的首席研究員Karen Miga說道,“通過納米孔測序,我們獲得了能跨越整個重復(fù)區(qū)域的數(shù)十萬堿基對的超長讀數(shù),從而繞過了一些挑戰(zhàn)。”
利用這項技術(shù),研究小組能填補(bǔ)著絲粒上的一個巨大缺口,該缺口由310萬堿基對重復(fù)的DNA組成。而這些以前未被探索過的地區(qū)可能會被證明對科學(xué)研究特別有價值。
Miga表示:“我們開始發(fā)現(xiàn),參考序列中存在空白的一些區(qū)域?qū)嶋H上是人類變異最豐富的區(qū)域之一,因此我們一直缺失了許多可能對理解人類生物學(xué)和疾病非常重要的信息。”
但X染色體只是一個開始。眼下還剩下23條染色體有待科學(xué)家去發(fā)現(xiàn),該項目計劃在2020年底將它們?nèi)坷L制出來。
本文來源自網(wǎng)絡(luò)
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